بعد از یک دوره عملیات عادی، عنصر غشایی با مواد جامد معلق یا مواد مقاوم از آب که ممکن است در آب تغذیه وجود داشته باشد، آلوده است. در شرایط استاندارد عملکرد سیستم کاهش 10٪، و یا بدیهی است که رخنه مقیاس یا سمی، باید آن را فورا تمیز. به طور منظم شستشو و دوز شستشو انجام می شود تا عملکرد عنصر غشا را بهبود بخشد و عمر عنصر غشا را افزایش دهد.
سیستم باید هر 5 روز یک بار در کوتاه مدت شستشو داده و بعد از مسواک زدن شیر را برای جلوگیری از اشباع قفل کنید.
قطع سیستم درازمدت (بیش از 30 روز)، افزودن 1٪ محلول بیسولفیت سدیم برای جلوگیری از رشد باکتری ها.
